温度是堆肥的一个关键质保。系统会不会升温？升温多高？它能保持多久？原料配比怎样影响温度？所有这些都是堆肥工作人员所关心的。
热量是由微生物降解有机物产生的，可以根据堆肥温度来判断系统进行得怎样，以及分解过程怎样。堆肥温度不能太低也不能太高。温度低温生物的反应速率慢，发酵时间长，易产生臭气且不能达到高温杀灭致病菌即无害化的要求；温度过高如超过70℃时，杀灭致病菌的同时也将放线菌、嗜热菌杀死，不利于堆肥进程。因此堆肥适宜温度为50～65℃.例如，如果堆肥温度达到40～50℃时，则可以推断堆肥组分含有足够的氮和水分供微生物快速增长。
读取温度时，一定要确保将温度计深入堆肥内部，将温度计放置一会儿，使温度稳定后再进行读数，然后将其移至一新位置。堆肥的温度有高有低，这主要取决于水分含量和堆肥组分的化学组成。堆肥温度变化有一定的梯度变化规律，对于底部有通风的系统，温度最高的位置大约在离底部2/3或更高的一点的地方
