有机肥的发酵设施是使原材料中所含的有机物被好氧微生物分解、稳定，同时通过水分蒸发，使体积减少的设施。有机物在发酵设施中被分解、放热，使发酵设施里的物料的温度升高，并维持一定的高温时间，从而可以生产出安全、卫生的堆肥产品。
根据堆积情况、搅拌、翻堆方式的不同，处理方式有多种多样，决定处理方式时应考虑到原材料的条件、占地面积、作业性、环境条件、设备投资和运行成本等各方面因素。除此之外，还必须采用满足上述温度条件的发酵处理方式。
发酵设施主要包括发酵曹、翻堆机、布料机、移行车。其中，发酵槽单槽尺寸（L×W×H）通常为（60～100）m×（4～6）m×（·～1.2）m，槽的壁上部铺设导轨，便于布料车、翻堆机行走。翻堆机的主要作用是通过机械搅动将物料搅拌均匀，促进热量和水分挥发并将物料在槽内缓慢位移，主要由行走底盘部分、搅拌齿、液压升降部分、传动部分及电控部分组成。典型翻堆机的行走速度0.6m/min、搅拌轴转速32.5r/min、工作幅宽6m、行走动力2×0.75kw 、搅拌动力2×7.5kw。布料车的作用是将物料均匀地撒布在发酵槽内，有行走底盘、布料都、传动部件等构成。典型布料车行走速度11.5m/min、车旋转速度0.036r/min、配套动力2×0.75kw、布料斗有效容积6立方米、工作幅宽8m、布料斗旋转角范围0～180度。移行车的作用是用于将翻堆机及布料车从一个槽移至另一个槽上，一般配套动力2×0.75kw、运行速度0.8m/min。
