有机肥的某些基质可能除了需要进行水分和孔隙调整外，还需其他的调节，如有些富纤维物质像庭院垃圾和部分城市固体废物，可能缺少微生物快速增长的必需营养，所以，需对初始基质进行调节，以保证生物有合适的环境生长繁殖。
另外堆肥基质滿要一些无机营养来保证微生物的生长。在堆肥系统中氮的需求比其他无机营养物高，所以主要调节氮营养。
在好氧代谢过程中，微生物利用1份氮需耍15～30份碳，即C/N=15～30。如來C/N 增加，则堆肥时间延长，如C/N为20,堆肥需要12天，C/N为78，则需要21天。含氮量低会造成“氮”营养受限，限制微生物生长，影响整个堆肥进程?去除一部分高含碳物质或 (和）加人一些高含瓿物质可以解决商C/N的问题。
如果C/N≤15,则氮过量，不会出现氮限制的情况。堆肥文献中通常认为混合基质的C/N必须在15～30范围内，其实不然，只是C/N在15～30时可避免氮营养受限。当C/N 小于15时，过量的氮会随氨挥发而损失。
应用C/N时一般假定碳源和氮源基质都是易降解的。需注意的是：对于难降解的有机氮，则不管C/N多少，这部分氮都是无效的。所幸的是，自然状态下基质所含的氮绝大部分都是在蛋白质分子中，相对易降解。另外，如果存在难降解的碳源基质，即使是高C/N， 也不会影响堆肥进程，因为这部分碳几乎不参与微生物的分解和合成。
