有机肥发酵物料的分解主要发生在颗粒的表面或接近颗粒表面的地方，由于氧气可以扩散进入包裹颗粒的水膜，所以这些地方有足够的氧气保证有氧代谢的需求。
在相同体积或质量的情况下，小颗粒要比大颗粒有更大的表面积。所以如果供氧充足，小颗粒物料一般降解得要快一些。实验证明将发酵物料加以粉碎后，可以使降解速率提高2倍以上。一般推荐的颗粒粒径为1.3～7.6mm，这个区间的下限适用于通风或连续翻堆的发酵系统，上限适用于静态堆垛或其他静态通风发酵系统。
对湿基质进行结构调整时，调理剂的粒径大小也会起到非常重要的作用。如果调理剂粒径过小，会导致难以达到预期的自由通气孔隙，并可能使混合基质固相体积不易达标。例如，有些发酵系统由于使用粒径很小的称为“木粉”的木屑，导致混合基质呈饱和泥状，由于缺少空隙而易发生厌氧反应。为规范调理剂的使用，美国一些地方规定木屑应不少于总固相的65%，95%可以通过12mm筛，而通过2.23mm的应小于50%；有的规定粗木屑占固相的50%～70%，95%可通过12.5mm筛，通过4.75mm的应小于20%。同时，对粒径大的颗粒进行限制是为了避免最后的产品颗粒过大而需过筛。如果发酵产品应用于园艺或在草坪、花园上施用时，粒径一般不要大于10mm。
总之，小颗粒调理剂如木屑等易于生物降解，但从结构角度来看，应避免使用过多的小颗粒。
