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通过应用微生物无害化活菌制剂发酵技术处理畜禽粪便是比较科学、理想、经济实用的方法,所产生的无害化生物有机肥是一种重要的肥料资源。用于生产生物有机肥的菌种应具备对固体有机物发酵的性能,即能通过发酵作用使有机废弃物腐熟、除臭和干燥。目前,用于固体有机肥物发酵的菌种主要有丝状真菌、担子菌、酵母菌和放线菌,也可采用光合细菌与上述的一些菌种制成发酵剂用于固体有机废弃物的发酵。此方法一般要求畜禽粪便中的有机质含量在30%以上,最好在50%~70%;碳氮比为30~35:1,腐熟后达到15~20:1;PH6~7.5;水分含量控制在50%左右为宜,在有些加菌发酵方法中可调节到30%~70%。如果再发酵后进行干燥、粉碎,加入一定配比的无机氮、磷、钾肥料,复混造粒就制成了另一种新型的生物有机复合肥。生产微生物有机肥料的方法有平地堆置发酵法、发酵槽发酵法、塔式发酵罐发酵法等。畜禽粪便通过生物发酵处理后消除了病菌、虫卵等有害微生物,使环境得到改善和净化。生物有机肥含有益微生物菌群,根际促生效果好、肥效高,同时富含有机、无机养分及生理活性物质,体积小、便于施用、安全无公害,能满足规模化生产和使用要求。