堆肥过程的初期加入微生物，其目的是促进堆肥腐熟，缩短堆制周期。
传统的堆肥法堆肥腐熟的时间常需2个月，堆制过程中堆肥周围恶臭难闻，污水流淌，蚊蝇滋生，成为农业环境屮重要的 污染源。因此如何缩短堆制时间，使新鲜畜禽粪便快速腐熟， 是现代农业生产中急待解决的问题。由于 传统堆肥腐熟过程 主要是一个由自然微生物参与的生理生化过程，因而有可能利用添加外源微生物来加速该过程。
接种微生物促进堆肥腐熟的机理有:①提高堆肥初期微生物的群体，增强微生物的降解活性；②缩短达到高温期的时间； ③接种分解有机物质能力强的微生物。一些从堆肥屮分离出 来的高温菌、中温菌、放线菌和真菌常作为堆肥接种剂加速细 胞壁和木质素、纤维素水解，促进腐殖化过程。目前应用的主 要三种接种剂：微生物培养剂，营养添加剂，有效的自然材料。 有效自然材料主要是指粪便堆肥、牛粪、耕层土壤和菜园土壤等，其中含有种类极其丰富的微生物群体。
