以前养鸡数量很少的时候，鸡粪是很好的农家肥料。特别是我国又是一个农业大国，鸡粪是很好的有机肥料，但是随着化肥的普及，越来越少的种植户会采用有机肥。养鸡场的数量越多和规模也越来越大，需要鸡粪人越来越少，鸡粪越来越多，此消彼长，鸡粪现在可以说是所有养鸡场头痛的问题。
鸡粪虽然是一种比较优质的有机肥，但是鸡粪没有经过发酵是不能直接施用的，鸡粪直接施在土里的时候，它会直接在土里发酵，发酵时候产生的热量会影响农作物果苗等生长，烧毁农作物的根系，这就是所谓的烧根了。
以前也有人将鸡粪作为牛、猪等的饲料，但是也是由于工艺比较复杂。很难成规模化去运用；有些人也把鸡粪烘干，但是把鸡粪烘干消耗了太多的能量，成本太高，也不是一个可持续发展的模式。
经过人们长期的实践，鸡粪发酵依然是一个比较可行的方法。鸡粪发酵分为传统发酵以及微生物快速发酵。
一、传统发酵
传统的发酵需要时间比较久，一般需要1到3个月的时间。而且周围恶臭难闻，蚊蝇大量滋生，环境污染十分严重。当鸡粪比较湿的时候，需要加以辅料，需要的人工比较多。在发酵的过程中，要用采用翻耙机翻耙，是一种比较原始的处理方式。
虽然传统发酵的设备投入比较低，但是如今人工高昂的情况下，采用传统发酵处理1吨的鸡粪成本也是比较高的，将来传统发酵将会被淘汰。
二、微生物快速发酵
微生物快速发酵是将复杂的有机质分解成简单的有机质，也将有机质分解成更复杂的有机质，是有机物不断降解和分解，直到分解成可以被土地利用的有机肥。有机物矿质化为微生物提供养分，产生较多的二氧化碳水及其他养分物质，分解速度加快，而且彻底并放出大量的热量。所以发酵速度是非常快的，一般从鸡粪变成有机肥，只需一个星期左右的时间。
微生物快速发酵，采用的原理就是：生物质在合适的温度下，也非常适宜的环境下快速繁殖，快速分解，一般在45到70度的范围内，微生物生长的代谢非常的快，同时也把粪便中的细菌及有害物质等杀死。采用一个比较封闭的小环境下，微生物可以持续的发酵，只需要通过正常的加料，生产出料等过程，就可以快速将鸡粪转化成有机肥。
经过微生物快速发酵的处理后的鸡粪，没有一点的臭味，而且含水量只是在30%左右。而且微生物快速发酵能够彻底将有害的气体处理之后再排放，完全没有一点会污染环境。利用微生物快速发酵的方法，能够改善饲养环境，提高生产效益，生产出来的干鸡粪更是绿色食品，有机产品等的优质肥料。
